農畜産物ゲノム情報データベース

動物ゲノムデータベース


AGP
生物種: Sus scrofa domestica, Gallus gallus
説明: ブタのゲノム塩基配列、発現遺伝子解析といった基盤的なゲノム解析研究とともに、ゲノム情報を最大限に利用した免疫遺伝学・抗病性解析研究を通じ、ブタの抗病性育種、家畜衛生、またモデル動物としてのブタの利用促進を目指す研究グループです。またニワトリの抗病性解析についても研究を行っています。

PEDE
生物種: Sus scrofa
説明: ブタのゲノム(コンティグ)やcDNA、cSNP(cDNA上のSNP)の配列情報を格納したデータベースです。 絞り込み検索により配列やその注釈情報(他種の配列との類似性検索結果等)を参照できます。   また配列のダウンロードやお手持ちの配列との類似性検索(BLAST)もできます。

Swine Linkage Map Viewer
生物種: Sus scrofa
説明: ブタの連鎖解析により得られたマーカ情報を格納したデータベースです。グラフィカルな連鎖地図ビューアによりマーカの連鎖位置や解析情報を参照できます。

Swine Marker Viewer
生物種: Sus scrofa
説明: ブタのマーカ情報を格納したデータベースです。キーワード等の絞り込み検索により、マーカの解析情報を参照できます。

Additional data for the publication of SSRH map
生物種: Sus scrofa
説明: ブタの放射線雑種細胞パネル(SSRH)情報を格納したデータベースです。 SSRHデータのダウンロードや、グラフィカルなビューアによるSSRH地図情報を参照できます。